很久以前银河系是和平的，这个天堂由科学之手维持秩序。而科学之手，指的就是银河系的主宰─核心。

　　矛盾的是终极的胜利却带来乐园的崩溃和数以百万个星球的灭亡。战争的起因是一种叫"铸造"的程序，它能够把人脑和意识转移到不死的机器上，这是不道德的行为，但核心下令强制所有市民接受铸造以确保自身的安全。

　　有许多不愿身体物化的人，认为铸造是一种暴政。他们群聚在银河 的边缘反抗核心的统治，被称为武力。於是，虽然没有宣战，战争却已展开。武力为武士开发了高能战斗服，对手就是经过铸造的不死机器，核心不断复制最强的战士，武力也坚强的反攻。战争延续 了4,000年，几乎耗尽银河系的资源，仅存一片焦土。

　　双方都已兵疲马顿、人员死伤殆尽。剩余的人马正准备作最后的决战，他们只有散处各地的残余兵力，在战火蹂躏的土地上对峙，为理念而战、至死方休。唯一的结果是其中一方将敌人彻底消灭。

　　"核子"输掉了4,000年来与"武力"对抗的战争，银河系即将由武力(ARM)进行重整，但是传说中战争末期核子指挥官(Core Commander)在机密的复活计画中活存下来竟然成真!核子与武力双方正竞相发展新的外星科技，唯一幸存的CORE欲藉此彻底摧毁ARM及银河系。 一触即发的核子风云就要开始了…